Датой рождения «Апатита» считается 13 ноября 1929 года – день создания треста «Апатит», первым управляющим которого стал Василий Иванович Кондриков. Однако еще 7 октября первый на «Апатите» Кировский рудник дал первую тонну руды. Всего в 1929 году на предприятии произвели 1,5 тысячи тонн руды, в 1930-м – уже 170 тысяч тонн, 1 марта 1932-го начались подземные горные работы.

1940-1950 г.г. В годы Великой Отечественной войны оборудование предприятия демонтировалось и было отправлено на Средний Урал и в Казахстан. Производство было приостановлено, работал лишь опытный химический завод в Кировске и часть Кировского рудника – исключительно на оборонный заказ.
Однако еще до окончания войны перед предприятием была поставлена цель - возобновить производство апатитового концентрата для нужд сельского хозяйства. В короткие сроки была реанимирована первая апатит-нефелиновая фабрика, и весной 1944 года «Апатит» возобновил выработку продукции.

1950-1960 г.г. В 1952 году на комбинате «Апатит» создан ремонтно-механический цех.
В середине 50-х годов сооружаются новые подземные рудники - Юкспоррский и Расвумчоррский. К концу 1957 года закончены основные строительные работы по сооружению Юкспорского тоннеля. Введены в эксплуатацию хвостохранилище апатитовой фабрики, корпус флотации и доизмельчения АНОФ-1, галереи №№ 7 и 8 нефелиновой фабрики, железнодорожный мост через реку Белую, бытовой комбинат Юкспорского рудника, горные выработки рудника Юкспор. Геологи Хибиногорской комплексной геологической экспедиции начали детальную разведку месторождения апатит-нефелиновых руд на плато Расвумчорр. Вступил в строй Дворец культуры комбината со зрительным залом на 730 мест. Введены в эксплуатацию ТЭЦ комбината, ряд объектов стройбазы треста «Апатитстрой» (бетонорастворный узел, цех разделки леса, железнодорожные пути и др.).

1960 – 1970 г.г. В 1964 г. введен в эксплуатацию первый открытый, расположенный на километровой высоте на плато Расвумчорр - Центральный рудник. В 1965 году проходчик–взрывник Кировского рудника М.Ф. Чуйкин первым в истории предприятия удостоен звания Героя Социалистического Труда.
В 1966 году бригадиру проходчиков Кировского рудника А.М. Ананьеву присвоено звание Героя Социалистического труда. Одновременно большая группа горняков и обогатителей комбината награждена орденами и медалями СССР за успешное выполнение заданий семилетнего плана. В середине 60-х введена в строй АНОФ-2, крупнейшая обогатительная фабрика не только в СССР, но и в Европе. С 1 млн.тонн в 1950 году выработка апатитового концентрата достигла в 1967 году уровня 9 млн.тонн. Большие усилия были направлены на более эффективную отработку апатит-нефелиновых руд и разработку более совершенной технологии их обогащения. И это было оправдано - страна с каждым годом требовала все больше апатитового концентрата. Совет Министров СССР принял постановление об использовании хибинского нефелина в народном хозяйстве страны.

1970-1980 г.г. На 70-е годы приходится период досрочного выполнения основных заданий
VIII и IX пятилеток и социалистических обязательств. Комбинат «Апатит» имени С.М. Кирова награжден орденом Октябрьской Революции. В 1972 году обогатители выработали сверх годового плана 425 тыс. т апатитового концентрата – больше, чем за какой-либо другой год своего существования. В 1978 году погружены первые кубометры вскрышной породы на месторождении Коашва – фактическое начало горных работ на Восточном руднике. В этом же году по коллекторам АНОФ-2 впервые пошла оборотная вода (начало крупномасштабного промышленного эксперимента по внедрению оборотного водоснабжения). В 1979 году начало строительства АНОФ-3 и добыта 600-миллионная с начала разработки хибинских месторождений тонна апатит-нефелиновой руды.

1980 – 1990 г.г. В 1977 году была добыта 500 млн. тонна руды, в конце 80-х годов добыча руды достигла 60 млн. тонн в год, а потребителям отгружалось около 20 млн. тонн апатита, которые вырабатывались к тому времени уже тремя обогатительными фабриками. В этот же период предприятие перешагнуло миллиардный рубеж по добыче руды.
В Центральной лаборатории производственного объединения «Апатит» из сфенового концентрата на опытно-промышленной установке «Пигмент» выработаны первые 70 килограммов титано-кальциевого пигмента. На АНОФ-2 создан участок контроля за технологией процесса обогащения апатит-нефелиновых руд. Два года спустя он преобразован в автоматизированную службу аналитического контроля (АСАК).
В 1988 г. объединение «Апатит» произвело 20 млн. т апатитового концентрата, что стало абсолютным рекордом во всей истории предприятия.

1990-2000 г.г. 90-е годы прошлого столетия оказались самыми трудными для предприятия. Стремительное сокращение спроса на апатитовый концентрат поставило предприятие на грань выживания. В 1994 году произошло резкое падение уровня производства апатитового концентрата до 6 млн. тонн. Капитальное строительство было остановлено. Ряд объектов был законсервирован. Реально встал вопрос о дальнейшем существовании предприятия.

Переломным моментом в истории предприятия, которое сначала было акционировано, а затем приватизировано, стали 1996 – 1997 годы. С целью поиска путей выхода из критической ситуации и улучшения финансового положения командой менеджеров ОАО «Апатит» на основе глубокого анализа состояния рудно-сырьевой базы и обогатительного производства предприятия была разработана концепция стратегического развития «Апатита». Были определены варианты рационального развития рудно–сырьевой базы и поддержания обогатительных мощностей, которые легли в основу „ТЭО оптимального развития объединения до 2005 года и на дальнейшую перспективу“, выполненного группой институтов (НИУИФ, Гипроруда, Механобр-Инжиниринг, НИИГипрохим).
 
Выполнение этой программы позволило ОАО «Апатит» выйти из критической ситуации, стабилизировать свою работу и приступить к развитию производства. Немаловажно и то, что к управлению предприятием пришла команда молодых менеджеров, которые удачно используют опыт специалистов старшего поколения, объединенных в консультационно-аналитический отдел.

Активная маркетинговая политика привела к расширению рынков сбыта и увеличению заказов на апатитовый концентрат. Обновление парка технологических машин, стабилизация затрат, новая кадровая и социальная политики способствовали наращиванию объема производства основного вида продукции - с 6,0 млн. тонн до оптимального уровня 8,5-9 млн. тонн (такой же объём производства поддерживается в настоящее время). Благодаря этому апатитовый концентрат за последние годы стал более востребован внутри страны и значительно более конкурентоспособен на мировом рынке.
На сегодняшний день ОАО «Апатит» укрепил свои позиции, как в техническом, так и в финансовом отношении. Предприятие является одним из крупнейших налогоплательщиков в Мурманской области, доля его грузов на Мурманском направлении Октябрьской железной дороги составляет порядка 40 процентов, примерно такой же уровень грузоперевозок – и в Мурманском морском порту.

2000-2005 г.г. В течение последних пяти лет ОАО «Апатит» один за другим вводит в строй социальные объекты – первое в Мурманской области Интернет-кафе, детское кафе «Сказка», бизнес-центр, крытый хоккейный стадион, горнолыжный комплекс ОАО «Апатит» на южном склоне горы Айкуайвенчорр, боулинг-центр «Большой Вудъявр»
В декабре 2001 года добыта 1,5-миллиардная тонна апатит-нефелиновой руды. Горно-химический комплекс в Хибинах первым в истории России достиг такой огромной цифры по объемам добычи руды всего за 72 года своего существования. С 2002 года «Апатит» входит в компанию «ФосАгро»
В 2002 году в Хибинах прошел первый спортивный фестиваль, главным организатором и спонсором которого выступило ОАО «Апатит». Торжественно введен в эксплуатацию горизонт +172 метра с комплексом подземного дробления Кировского рудника.
В 2004 году исполнилось 50 лет Расвумчоррскому и 75 лет Кировскому рудникам. В рамках празднования 75-летия предприятия состоялось торжественное открытие памятника первому директору комбината «Апатит» Василию Ивановичу Кондрикову. В Кировске завершено сооружение здания нового православного храма Спаса нерукотворного образа Иисуса Христа на ул. Солнечной.

Награды

За успешное выполнение государственных заданий в 1965 году комбинат «Апатит» награжден орденом Ленина, а в 1971 году – орденом Октябрьской Революции. В том же году апатитовому концентрату, выпускаемому предприятием, был присвоен государственный Знак качества, а в 1980 году предприятие удостоено международной премии «Золотой Меркурий».
В 2002 году Совет конкурса «Всероссийская марка. Знак качества XXI века» отметил апатитовые концентраты «Стандарт» и «Супер» Платиновыми Знаками качества.